(一)辦公室。負責局綜合協調工作;負責文秘、信訪輿情、政務信息公開、宣傳、接待、安全保衛、會務、機要保密、檔案、公車管理、辦公用房等工作;牽頭組織愛國衛生工作和精神文明單位創建工作;負責督促局各項工作的部署落實;組織、協調重大事項的督辦;承擔建議提案辦理工作。

(二)法規股。負責組織協調推進本系統依法行政、依法治理工作。負責擬訂行業法制建設規劃并組織實施。承擔局重大行政決策和規范性文件的合法性審查及重大執法決定法制審核工作。指導交通運輸綜合行政執法和執法隊伍建設相關工作。承擔交通行政訴訟和國家賠償案件等相關工作。承擔政府信息依申請公開工作。承擔政策法規宣傳和普法教育工作。承擔本部門權責清單制度建設、動態調整等相關工作。

(三)審批服務股。按照授權范圍負責統一受理、辦理本部門審批服務事項;統籌協調相關股室審批服務業務辦理，實行一個窗口對外，限時辦結;參與涉及多部門審批服務事項的聯審聯辦工作，按照聯審決定受理、辦理本部門有關手續;交辦需現場查勘的審批事項;負責駐市政務服務中心窗口的日常管理工作;負責交通運輸行業誠信考核的綜合評價;負責互聯網和政務服務工作。

(四)規劃計劃統計股。擬訂交通運輸行業發展規劃和計劃；負責全市交通基礎設施建設規劃內和年度計劃規模內的計劃申報、下達；負責擬訂和下達權限內道路、水路、鐵路、交通基礎設施、城市公共交通、區域綜合交通運輸樞紐、物流業等專項發展規劃和實施計劃;負責組織交通運輸行業綜合統計、預測、信息引導、普查和專項調查工作;參與全市交通救災應急資金的核定、申報工作；按照分工，參與對公路、水運工程項目施工圖設計的審查;按權限承擔、指導交通運輸建設項目計劃的申報(含橋梁、隧道建設項目)工作;參與交通運輸建設項目(包括城市地鐵軌道建設、水上含渡口港口碼頭建設、農村公路建設)等行業行政許可的現場勘驗和審查；承擔企市交通運輸國防戰備動員有關工作，擬訂交通戰備建設規劃和戰時交通運輸保障計劃，負責對交通基礎建設提出貫徹國防要求的建議，管理全市國防交通工程;指導、監督交通戰備隊伍建設;負責全市國防運力動員和運力征用;組織全市國防交通科學技術研究及其成果的推廣、應用。

(五)基本建設股。負責全市農村公路、水運建設管理工作；擬訂全市公路、水運建設行業技術標準;指導和統籌公路、水運建設項目的前期工作;負責交通運輸建設項目(包括城市地鐵軌道建設、水上含渡口港口碼頭建設、農村公路建設)權限內行政許可的現場勘驗和審查;承擔全市權限內的公路、水運建設項目初步設計、施工圖設計、施工許可等相關審查工作；管理全市公路、水運建設工程質量和定額、造價控制、交通公路水運建設項目竣工驗收和后評估工作。負責管理全市交通運輸建設項目招投標工作，營造公平競爭的招投標市場氣氛，維護全市公路、水運建設市場秩序，處理招投標活動中的信訪投訴，承擔交通運輸建設項目中標企業中標后履約情況的標后稽查和全市交通建設項目招標代理企業的代理行為實施全過程的監督管理工作;承擔維護交通運輸建設項目農民工權益相關工作;負責全市交通建設項目設計、施工、監理等從業單位資質的監督管理及信用評價和轉報工作;牽頭組織權限內公路、水運工程的竣工驗收工作。

(六)公路管理股。負責公路管理法律、法規及規章的宣傳、貫徹執行工作;指導全市公路(含國道、省道、縣道、鄉道、村道)建設、養護和農村公路行業管理工作;承擔全市公路建設、養護的檢查、評估工作;指導、協調全市國道、省道路網運行監測工作;牽頭監管公路建設行業環保工作;參與公路管理的行政許可審核工作;協助做好公路建設項目(含橋梁、隧道建設項目)的前期工作;擬訂全市農村公路建設、養護相關制度并組織實施;指導全市農村公路數據庫建設、應用相關工作;指導全市公路管理的應急搶險工作。

(七)運輸管理股。負責行業平安建設和精神文明建設工作；參與擬訂交通運輸行業發展規劃;指導交通運輸基本公共服務標準的實施；承擔客運站場服務質量等級評定、客運班線車輛的糾紛裁定;承擔全市道路客貨運輸和汽車維修、搬運裝卸、駕駛員培訓、道路運輸站場的管理工作;指導城鄉客運及有關設施的規劃、運營管理工作；指導公共汽車運營線路和站點的設置與調整;承擔轄區公共汽車、出租汽車等公共交通運營管理工作;指導港口水域岸線的管理使用；負責對地方航道養護、航標設置等相關技術標準的監督實施；指導做好道路站場項目、水運工程建設項目前期工作;指導做好水路運輸和港口(不含漁港)安全生產應急預案;負責權限內防治船舶污染內河水域環境的監督管理工作;牽頭監管道路、水路運輸環保工作;承擔物流市場有關管理工作;組織協調重點物資運輸和緊急客貨道路運輸;協調郵政、鐵路、民航等單位涉及地方的運輸相關工作;負責校車通行線路現場勘察核準和審批工作。

(八)安全管理股(應急管理辦公室)。參與擬訂全市綜合性安全生產有關管理辦法(制度);指導交通運輸安全生產體系建設;督促指導轄區內公路交通、道路運輸、道路安全、水上交通、地方鐵路、交通工程質量安全和造價管理等業務領域內安全生產管理工作;指導全市交通運輸行業應急管理工作;依法組織或參與有關事故調查處理工作;負責全市交通行業傷亡事故的統計、信息上報工作。

(九)科技信息股。管理和指導全市交通運輸行業的科學技術、信息化工作;擬訂交通運輸行業科技、信息化政策、規劃和計劃并組織實施，組織開展交通運輸有關重大科技項目研究和成果推廣工作;宣傳和貫徹綜合交通運輸標準;承擔交通運輸系統信息化建設、信息資源開發利用、計算機網絡管理工作；協調做好交通信息化項目的前期工作。

(十)財務股。指導、監督全市交通輸系統的財務會計工作及國有資產管理工作;負責局機關及所屬單位各項財務收支預決算的編報、匯總、審查工作;承擔交通運輸系統資金的申請、撥付和監管工作;承擔局機關及所屬單位會計核算和財務管理工作;承擔全市交通運輸事業發展資金的績效監督和管理工作;負責交通運輸系統內部財務審計工作。

(十一)人事股。承擔局機關及所屬事業單位機構編制、人事勞資、教育培訓、專業技術人員管理等工作;負責管理權限內的干部任免調配、考核管理工作;負責績效考核工作;擬訂交通行業教育培訓規劃，組織交通行業的學歷教育、職業道德教育、職業技能開發工作;負責機關離退休人員管理、服務工作，指導局所屬事業單位離退休人員管理、服務工作。

(十二)黨建辦公室。負責局機關及所屬事業單位黨的建設工作，承擔機關黨委日常工作，指導各黨支部開展工作。牽頭組織全局意識形態和黨風廉政建設工作。